Con Decreto Ministeriale n. 411 del 27 ottobre 2021 e con successivo Decreto Ministeriale n. 481 del 30 novembre 2021, sono state individuate le strutture ministeriali coinvolte nella governance del Piano, sulla base degli indirizzi forniti dalla Delibera CIPESS n. 2/2021. I Decreti Ministeriali individuano in particolare un’Autorità Responsabile del PSC, le singole strutture di attuazione, gestione e monitoraggio degli interventi, coincidenti con le Direzioni Generali competenti per materia, la struttura deputata ai controlli sulla spesa sostenuta dai Beneficiari e la struttura cui è demandata la gestione dei pagamenti.
Sempre sulla base degli indirizzi forniti dalla delibera CIPESS n. 2/2021, è stato altresì istituito il Comitato di Sorveglianza (CdS) per lo svolgimento delle funzioni di sorveglianza e dei compiti relativi all'attuazione degli obiettivi del Piano.
Il Comitato, presieduto dall'Autorità Responsabile, si riunisce almeno una volta all'anno per verificare l’efficacia dell’attuazione del Programma e i progressi compiuti nel conseguimento dei suoi obiettivi.
L'organizzazione sopra riportata fa riferimento al D.P.C.M. 23 dicembre 2020, n. 190, al D.P.C.M. 24 giugno 2021, n. 115 e al D.M. 30 maggio 2024, n. 151 che definisce l'articolazione delle strutture dirigenziali di II livello.